Fakultas Peternakan Universitas Wijayakusuma Purwokerto yang beralamat di Jl. Beji Karangsalam dirintis oleh Prof. drh. R. Djanuar didirikan pada tanggal 2 Juni 1988 dengan Nomor SK Pendirian 1446/14.34/Kop.VI/VI/1988. Pejabat Penandatangan SK Pendirian adalah Koordinator Kopertis Wilayah VI. Fakultas Peternakan merupakan salah satu dari 5 (lima) fakultas yang ada di Universitas Wijaya Kusuma Purwokerto, Jawa Tengah. Universitas Wijaya Kusuma Purwokerto (disingkat UNWIKU) adalah perguruan tinggi swasta yang berlokasi di Kota Purwokerto, Kabupaten Banyumas. UNWIKU didirikan pada tahun 1980 bertujuan menghasilkan lulusan yang tangguh, cakap namun rendah hati dan berjiwa pancasila.

Dasar hukum Yayasan Wijayakusuma sebagai penyelenggara pendidikan tinggi adalah Piagam Pendirian Perusahaan No. 29 Tahun 1980, akta notaris Ratna Diwati, SH. Disahkan oleh Pengadilan Negeri Purwokert No. 62/1980/AKTA tanggal 7 Juni 1980 dan tanggal 19 Agustus 1980. Pada tahun 1981, Unwiku mengenyam pendidikan di Fakultas Hukum,  Sosial dan Ilmu Politik, Politik Nasional, Teknik, Teknik Sipil, Ekonomi, Administrasi Niaga, dan Ekonomi Umum. Program Produksi Peternakan disahkan berdasarkan Keputusan Menteri Pendidikan Tinggi dan Kebudayaan Republik Indonesia No. 238/O/1989 tanggal 12 Juni 1989.

Hasil evaluasi penyelenggaraan pendidikan Jurusan Produksi Ternak dengan Proram Studi  Produksi Ternak oleh Kopertis Wilayah VI dinyatakan memenuhi syarat mendapat predikat terdaftar, sehingga pada 17 Januari 1990 mendapat status terdaftar dengan Keputusan Menteri Pendidikan Tinggi dan Kebudayaan Republik Indonesia nomor 047/O/1990. Tahun 2011 berdasarkan SK izin operasional dengan nomor 7829/D/T/K-VI/2011, Fakultas Peternakan UNWIKU mendapat Peringkat Nilai Akreditasi B. Berlanjut tahun 2018 status akreditasi Program Studi Peternakan adalah B berdasarkan Keputusan BAN-PT No. 1754/SK/BAN- PT /Akred/S/VII/2018.

Berdasarkan Surat Keputusan Direktur Dewan Eksekutif BAN-PT No. 4232/SK/BAN-PT/Ak.KP/S/V/2024, menyatakan bahwa Program Studi Peternakan, Pada Program Sarjana Universitas Wijayakusuma Purwokerto, Kabupaten Banyumas memenuhi syarat peringkat Akreditasi Baik Sekali